MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 chromosome

Total Repeats: 101706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015687	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015687	A	8	8	90	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015687	TACC	2	8	121	128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015687	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015687	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015687	T	6	6	166	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015687	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015687	T	10	10	230	239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015687	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015687	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015687	T	6	6	352	357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015687	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015687	TTTA	2	8	428	435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015687	AAAT	2	8	436	443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015687	T	7	7	443	449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015687	AGG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015687	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	337735210
18	NC_015687	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
19	NC_015687	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
20	NC_015687	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
21	NC_015687	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735210
22	NC_015687	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	337735210
23	NC_015687	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
24	NC_015687	ACAA	2	8	755	762	75 %	0 %	0 %	25 %	337735210
25	NC_015687	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
26	NC_015687	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735210
27	NC_015687	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735210
28	NC_015687	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337735210
29	NC_015687	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735210
30	NC_015687	TA	3	6	904	909	50 %	50 %	0 %	0 %	337735210
31	NC_015687	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
32	NC_015687	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
33	NC_015687	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
34	NC_015687	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735210
35	NC_015687	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735210
36	NC_015687	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	337735210
37	NC_015687	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
38	NC_015687	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	337735210
39	NC_015687	AACA	2	8	1178	1185	75 %	0 %	0 %	25 %	337735210
40	NC_015687	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735210
41	NC_015687	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
42	NC_015687	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	337735210
43	NC_015687	AG	3	6	1397	1402	50 %	0 %	50 %	0 %	337735210
44	NC_015687	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	337735210
45	NC_015687	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	337735210
46	NC_015687	AACT	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	337735210
47	NC_015687	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735210
48	NC_015687	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	337735210
49	NC_015687	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735210
50	NC_015687	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735210
51	NC_015687	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735210
52	NC_015687	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	337735210
53	NC_015687	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735210
54	NC_015687	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015687	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015687	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015687	AGT	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015687	TAA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015687	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015687	TTG	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015687	CAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015687	CTA	3	9	1983	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015687	TAC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015687	TAT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015687	TAA	2	6	2045	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015687	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015687	TAT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015687	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	337735211
69	NC_015687	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
70	NC_015687	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
71	NC_015687	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735211
72	NC_015687	AAAT	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	337735211
73	NC_015687	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
74	NC_015687	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735211
75	NC_015687	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
76	NC_015687	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
77	NC_015687	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
78	NC_015687	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	337735211
79	NC_015687	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	337735211
80	NC_015687	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
81	NC_015687	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
82	NC_015687	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
83	NC_015687	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	337735211
84	NC_015687	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
85	NC_015687	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735211
86	NC_015687	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735211
87	NC_015687	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
88	NC_015687	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
89	NC_015687	AG	4	8	2855	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	337735211
90	NC_015687	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
91	NC_015687	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
92	NC_015687	AATA	2	8	2969	2976	75 %	25 %	0 %	0 %	337735211
93	NC_015687	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735211
94	NC_015687	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735211
95	NC_015687	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735211
96	NC_015687	AGG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015687	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015687	AAGT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	25 %	0 %	337735212
99	NC_015687	TA	3	6	3288	3293	50 %	50 %	0 %	0 %	337735212
100	NC_015687	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735212
101	NC_015687	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	337735212
102	NC_015687	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015687	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
104	NC_015687	TA	3	6	3450	3455	50 %	50 %	0 %	0 %	337735213
105	NC_015687	A	6	6	3455	3460	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
106	NC_015687	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
107	NC_015687	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
108	NC_015687	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
109	NC_015687	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
110	NC_015687	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337735213
111	NC_015687	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
112	NC_015687	A	7	7	3687	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
113	NC_015687	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
114	NC_015687	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
115	NC_015687	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
116	NC_015687	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735213
117	NC_015687	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735213
118	NC_015687	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
119	NC_015687	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
120	NC_015687	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
121	NC_015687	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	337735213
122	NC_015687	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735213
123	NC_015687	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735213
124	NC_015687	ATTC	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	337735213
125	NC_015687	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735213
126	NC_015687	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735213
127	NC_015687	TTTA	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	337735213
128	NC_015687	AAAT	2	8	4243	4250	75 %	25 %	0 %	0 %	337735213
129	NC_015687	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735213
130	NC_015687	AT	4	8	4409	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	337735213
131	NC_015687	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735213
132	NC_015687	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	337735213
133	NC_015687	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735214
134	NC_015687	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
135	NC_015687	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735214
136	NC_015687	GGAT	2	8	4677	4684	25 %	25 %	50 %	0 %	337735214
137	NC_015687	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
138	NC_015687	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735214
139	NC_015687	AGG	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015687	A	7	7	4851	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	337735215
141	NC_015687	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735215
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